《水生態學》雜志論文投稿要求：
Ⅰ、正文各級標題應采用阿拉伯數字進行分級編號，一般不超過三級，前言不編號。
Ⅱ、注釋：要對文章內的特定內容（引用數據、觀點和結論）加以注釋。以腳注的形式，采用規范的標識與格式，在文章中的有關詞語、內容以及引文出處等的右上角等標識。
Ⅲ、論文及譯文均需增寫提要（200-300字）、關鍵詞（3~5個）和作者簡介。
Ⅳ、來稿請附作者真實姓名、工作/學習單位全稱、最后學歷/學位、職稱/職務、主要研究領域和詳細通訊地址（包括郵政編碼、電話和電子郵箱等），以便聯系。如有變動請及時通知。
Ⅴ、得到各類基金項目資助的論文，應在論文首頁標注（基金名稱、編號），并請提供有關批準文件的復印件一份。
雜志發文主題分析如下：
| 機構名稱 | 發文量 | 主要研究主題 |
| 水利部中國科學院水工... | 193 | 群落；水庫；群落結構；魚類；三峽... |
| 中國科學院 | 173 | 群落；群落結構；魚類；植物；浮游 |
| 華中農業大學 | 97 | 水庫；群落；群落結構；魚類；三峽... |
| 三峽大學 | 54 | 幼魚；魚類；游泳能力；水庫；臨界... |
| 中國水產科學研究院長... | 47 | 長江；魚類；群落；植物；群落結構 |
| 中國科學院大學 | 46 | 群落；植物；生態系統；魚類；底棲... |
| 學研究院 | 45 | 水質；養殖；植物；群落；浮游植物 |
| 上海海洋大學 | 45 | 群落；營養化；群落結構；富營養化... |
| 中國水利水電科學研究... | 37 | 魚類；河流；魚道；棲息；植被 |
| 河南師范大學 | 36 | 毒性；泥鰍；急性毒性；溫度；膀胱 |
雜志往期論文摘錄展示
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硫摻雜二氧化鈦的光催化活性及其對微囊藻毒素的降解
刺苦草對銅脅迫的耐受性及其恢復能力研究
